1、液體石蠟保存法：液體石蠟保存法就是在斜麵菌種或穿刺菌種表麵覆蓋一層液體石蠟，從而隔絕空氣，減少菌種及培養物水分揮發，保藏溫度要求在4℃下即可。將培養好的菌種斜麵，緩慢倒入無菌的液體石蠟，使石蠟高出斜麵頂端1厘米，直立放置，低溫保存就可以，黴菌、放線菌、芽孢細菌可保藏2年以上不死，酵母菌可保藏1-2年。

2、沙土保存法：沙土保藏法是將菌種吸附在適當的載體上，而後進行幹燥的保藏。將培養好的菌種接入沙土管內，用真空泵抽氣至幹。細菌、酵母菌、絲狀真菌均可用此法保藏，前兩者可保藏2年左右，有些絲狀真菌甚至可保藏14-17年之久。

3、甘油管保存法：甘油管保存是利用微生物在甘油中生長和代謝受到抑製的原理達到保藏目的。配置30%濃度的無菌甘油，將培養好的菌種與甘油充分混合均勻，放入-20℃保存。

4、冷凍幹燥保藏法：冷凍幹燥保存法就是將菌種與保護劑混合均勻後，快速冷凍，然後在減壓下利用升華現象除去水分，兼具低溫、幹燥、除氧三方。幹燥後的菌種在真空環境下可長期保存。

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